בישיבה אנו לומדים כל יום דף בבקיאות וחוזרים עליו ארבע פעמים בסדרי הישיבה (בשיטת הרב שבתי סבתו שליט"א). כך שלומדים כשליש מש"ס הגמרא בתקופת הישיבה במסגרת הישיבה, עם החזרות אנו לומדים כמניין הדפים בש"ס כולו. לימוד מקיף זה מייצר עוצמה מיוחדת בלימוד הגמרא.
ללימוד הבקיאות בגיל זה מעלות רבות וחשובות:
- רכישת היכולת ללמוד גמרא באופן עצמאי- הרבה מהקושי הנובע אצל תלמידים ללמוד גמרא באופן עצמאי נובע מחוסר ההיכרות עם הגמרא, הלימוד המקיף גורם להיכרות רבה עם הגמרא ולרכישת יכולת זו.
- אהבת לימוד הגמרא- נושא רכישת אהבת התורה בוער היום בקרב מחנכי ישראל, ללימוד הבקיאות חלק חשוב בקניין אהבת התורה, כיון שהלימוד מקנה ידיעות רבות וכמאמר שלמה המלך "שמחה לאיש במענה פיו".
- ידיעת התורה- בזכות הלימוד בהיקף גדול, ישנה היכרות טובה ורבה עם הרבה מהנושאים הנלמדים בבית במדרש היהודי.
